《九叔归来2》的叔归故事发生在民国初年的吉祥镇。九叔带着两位年轻徒弟行医济世，叔归却无意间卷入了一场神秘的叔归杀人案件之中。一具沉寂百年的叔归血棺在黄河岸边突然现世，贪婪的叔归大队长为了一己私欲擅自开启血棺，顿时释放出邪灵，叔归导致一系列诡异事件频发，叔归村民横尸遍地。叔归关键时刻，叔归九叔师徒及时赶到，叔归成功控制住肆虐的叔归猫僵。为了确保血棺的叔归安全运送，他们冒雨连夜出发，叔归途中被迫夜宿一家阴森客栈。叔归这家客栈的叔归掌柜及其妻子似乎暗藏不为人知的秘密，险象环生的场景与诡异气氛不断升级。在镇中危机四伏的情况下，隐藏在吉祥镇背后的阴谋逐渐浮出水面。正邪双方之间的对抗一触即发，一场惊心动魄的正邪大战即将上演……