在午夜的凹凸幽静中，神秘的学园钢琴声悄然响起，预示着凹凸学园新学期的第季开始。然而，凹凸随着开学钟声的学园敲响，校园内却频发一系列令人费解的第季谜团。从洒满阳光的凹凸美术教室突然弥漫起阵阵迷雾，到破旧老教学楼里飘散出难以抗拒的学园香气，种种迹象都指向一个不为人知的第季秘密。校方对这些事件闪烁其词，凹凸而背后的学园主使者竟拥有着关闭整个学园的权利！面对这扑朔迷离的第季局面，同学们不得不携手合作，凹凸揭开一个个隐藏在校园中的学园谜题，探寻真相的第季背后究竟隐藏着怎样的秘密？在这一季的故事中，他们将面临前所未有的挑战与冒险。