故事背景设定在19世纪初的天保日本江户时代，当时正值天保14年（1833年），异闻妖奇幕府政府实施财政紧缩政策，天保导致普通百姓生活困苦不堪。异闻妖奇同时，天保外敌入侵威胁着国家安全，异闻妖奇整个社会弥漫着一股不安的天保气息。在江户地下隐藏着一个秘密神社——“蛮社改所”，异闻妖奇表面上它是天保一个研究外国学术文化的机构，但实际上它的异闻妖奇真正使命是打击和消灭潜入日本的外国间谍，即所谓的天保“妖夷”。组织的异闻妖奇核心成员小笠原放三郎是一位醉心于“兰学”的学者，他努力证明这种外来知识的天保实用性。尽管小笠原自身武艺平平，异闻妖奇但他与拥有将汉字中蕴含的天保神秘力量“汉神”释放并具现化的能力的“妖奇士”龙导等人合作，共同肩负起保护江户安全的重任。他们的行动小心翼翼，力求在维护国家尊严的同时，又不引起不必要的公众恐慌。